Huyện Minh Long được thành lập theo Quyết định 41/HĐBT ngày 24/08/1981 của Hội đồng Bộ trưởng trên cơ sở chia tách huyện Nghĩa Minh thuộc tỉnh Nghĩa Bình thành 2 huyện Minh Long và Nghĩa Hành.

• Huyện Nghĩa Hành gồm có các xã Hành Đức, Hành Dũng, Hành Minh, Hành Phước, Hành Thịnh, Hành Thiện, Hành Thuận, Hành Tín.
• Huyện Minh Long gồm có các xã Long Hiệp, Long Mai, Long Môn, Long Sơn, Thanh An.

Năm 1989, sau khi tỉnh Nghĩa Bình chia tách thành 2 tỉnh Quảng Ngãi và Bình Định, huyện Minh Long là 1 huyện thuộc tỉnh Quảng Ngãi. Từ đó đến nay, huyện chưa có thay đổi hành chính.